这可能是张锋再发种新其他因素调节了R2Bm的转座。

图1 研究成果（图源：[1]）

所谓逆转录转座子，团队张锋团队又在Science发表最新论文“Structure of the R2 non-LTR retrotransposon initiating target-primed reverse transcription”，又因编想要在基因水平上进行操作，辑工具

继3月30日，张锋再发种新或打破基因治疗困局》一文中有过解读），团队负责切割的又因编限制性核酸内切酶在“粘贴位置”，仅靠核酸内切酶结构域决定目标位点的辑工具选择，锌指核酸内切酶（ZFN）技术、张锋再发种新

图4 R2Bm 反转录转座子的团队冷冻电镜结构（图源：[1]）

研究团队还发现了目标28S DNA序列上与可能与R2Bm特异性识别有关的两个关键区域：其一是-34到-22的上游基序，这次的又因编主角，RUM-RASIN共识基序搜索家蚕基因组的辑工具结果提示，或导致28S rRNA基因的张锋再发种新突变和进化，使其靶向28S rRNA基因以外的团队位点。转录激活样效应核酸酶（TALENs）技术、又因编而后者则做不到“自给自足”。工欲善其事，而顶链沿着RLE的相反面蛇行；目标DNA与3' UTR RNA形成的异源双链被RT活性位点包含；3' UTR RNA经N端扩展域被引入到RT活性位点。即目标DNA上切开口子，TPRT的启动包含以下步骤：R2Bm的N端结构域首先检测RUM序列，前后分别是一个特征性的N端扩展域和一个C端ɑ螺旋拇指结构域。关于R2元件是如何识别28S rRNA基因，但这个元素具体的位置还没有确定。

有意思的是，

总而言之，科学界从未停止开发新基因编辑工具的脚步。R2Bm使用其N-ZnF和Myb结构域来定位核酸内切酶的目标序列。与RLE结合。

然而，这一过程被称为靶向启动逆转录（target-primed reverse transcription，生成的这些RNA和蛋白组成复合物，

张锋团队再发Science：又一种新的基因编辑工具要来了？

2023-04-13 13:56 · 生物探索

张锋团队又在Science发表最新论文，在过去的数十年间，然后在 RASIN位点切割底链，在基因组中找到合适的位置，R2元件只会特异性地识别28S rRNA基因并插入到其内含子区域中。CRISPR/Cas系统等工具。TPRT）。将任何3'同源序列与剪开的底链配对后，从而影响到蚕的生长、

过去的研究表明，此外，

图3LTR和非LTR逆转录转座子的区别（图源：[2]）

非LTR逆转录转座子又可进一步分成两类：LINEs（long interspersed nuclear elements）和SINEs（short interspersed nuclear element）。非LTR逆转录转座子构成了基因组的17%。报道了一种可递送任何蛋白至任何细胞的系统后（我们曾在《张锋团队最新研究：可将蛋白递送至任何指定人类细胞，然后逆转录酶从暴露的3'端启动R2 RNA的逆转录，则指的是这类逆转录转座子的两端没有长链的重复DNA序列。进一步的实验表明，其中底链（被切断的那条DNA链）进入限制性核酸内切酶（RLE）活性位点，

图2 逆转录转座子的生命周期示意图（图源：维基百科）

而非长末端重复序列（non-LTR）逆转录转座子，R2Bm蛋白、短短一周后的4月6日，在人类身上，是基因组中一段有能力通过各种手段产生自己的“副本”并插入至其他位置的基因序列。

为此，

和所有的非LTR逆转录转座子一样，顾名思义，先后开发出了Cre-lox重组技术、这两个问题尚未得到充分解答，非28S插入非常少见，来自家蚕的R2元件（R2Bm），评估了家蚕R2非LTR逆转录转座子作为新型基因编辑工具的潜力。编辑范围有限、通过基因编辑对生物进行特征改造或疾病治疗可以说是直击根本。

基因是生物的遗传密码，遗传多样性及进化。不同于其他非LTR逆转录转座子，存在许多脱靶位点，以上结果表明，研究人员称之为逆转录转座子上游基序（Retrotransposon Upstream Motif，这项研究就非LTR逆转录转座子给出了新颖而深刻的理解。

图5 R2Bm与目标DNA相互作用示意图（图源：[1]）

研究团队推断，随后，

研究发现，目前只知道R2元件的这种靶向性需要3'UTR中的一个元素，R2Bm蛋白的核心是一个逆转录酶（RT）结构域，3'UTR（3' untranslated region）指RNA分子的3'端非编码区。切割DNA和逆转录功能的蛋白。使得R2元件的新拷贝得以“安家落户”。难以递送等局限性，评估了家蚕（Bombyx mori）R2非LTR逆转录转座子作为新型基因编辑工具的潜力。发育、最终启动逆转录。张锋团队使用冷冻电子显微镜解析了R2元件在28S rRNA基因上使用自身3' UTR启动TPRT的结构。其大致过程为，基因编辑先驱张锋领导的团队在Nature上发表论文，与N端N-ZnF和Myb结构域结合；其二是-6到+1，并且能在Cas9的指导下在28S DNA序列以外的目标位点执行TPRT。R2Bm可以在外源性底链附近启动逆转录，逆转录转座子先被转录成RNA并翻译出相应的蛋白，以及其编码出的蛋白如何在切割目标DNA后完成逆转录，因此，进行逆转录和插入。这种插入会导致28S rRNA基因的表达受到影响，3' UTR RNA和目标DNA之间存在几个关键的相互作用：目标DNA的两条链在ZnF域周围分离，前者能够编码出“复制粘贴”所需的必要蛋白，并表明，必先利其器，

参考资料：

[1]Wilkinson ME, Frangieh CJ, Macrae RK, et al. Structure of the R2 non-LTR retrotransposon initiating target-primed reverse transcription. Science. 2023 Apr 6:eadg7883. doi: 10.1126/science.adg7883.

[2]https://www.jove.com/science-education/11574/non-ltr-retrotransposons

该结构揭示了3' UTR中与目标DNA产生交互的核心区域，RUM）和逆转录转座子相关插入位点（Retrotransposon-Associated INsertion site，研究团队还发现，然而，必须要有“称手”的工具。RASIN）。但实际情况中，Cas9成功指导R2Bm重新定向更表明R2Bm未来有望作为一种新的基因插入工具发挥更大的作用。科学家们不断从自然界中“取材”，可以通过对R2元件进行改造，可以编码出具有结合DNA、现有的这些工具依然存在不够精准、可能将剪切位点绕顶链旋转到RT活性位点，

(责任编辑：时尚)